Priljubljene Objave

Izbira Urednika - 2019

Biostatistični pristop k genetiki prinaša nove sledi koreninam avtizma

Anonim

Študija je enako dobra kot orodja za analizo. Eno od teh orodij je statistika, medtem ko so biologi in kemiki vzpostavili in vodili poskuse, statistiki pa delajo z matematiko, ki ima smisel za vse podatke. Raziskovalci na Univerzi Rockefeller so nedavno razvili novo statistično metodo za genetske zaslone, ki izkoriščajo nedavno povečanje računalniške moči. Uporabili so ga za avtizem, odkrili so gene, ki niso bili predlagani v prejšnjih analizah.

oglas


Raziskovalci so z razkrojanjem podatkov iz genomov na stotine posameznikov z različnimi stopnjami avtizma ugotovili več funkcionalno povezanih genskih sprememb, za katere menijo, da so verjetno povezani z avtizmom ali z osnovno patologijo razvoja nevronov, ki bi lahko to povzročili.

Delo kaže, da začetek zdravljenja pri dojenčkih pri prvih simptomih, starih 12 mesecev, lahko spremeni potek bolezni. Raziskovalci lahko zgodaj odkrijejo motnjo, lahko preprečijo trajno "obrezovanje" nevronov, ki se pojavi v prvih dveh letih življenja, od cementiranja simptomov avtizma na mestu. Raziskovalci pravijo tudi, da se njihova metodologija za čiščenje podatkov lahko uporabi za prepoznavanje že neznanih genskih vzrokov za druge bolezni, tudi v primerih, ko so bili podatki že izčrpno analizirani.

Raziskava pod vodstvom Knuta Wittkowskega, biostatistika v Centru za klinične in translacijske znanosti pri Univerzitetni bolnišnici Rockefeller, je zasnovana na tradicionalni podatkovni metodi, ki je znana kot študija združevanja genomov. S primerjavo DNK iz skupin ljudi z določeno boleznijo do tistih brez njega, tehnika identificira genske spremembe, ki so povezane z boleznijo. Konvencionalne analize iščejo posamezne mutacije, imenovane SNP-enojno-nukleotidni polimorfizmi. Toda iskanje posameznih blipov v genetski kodi ni dokazalo zanesljivega načina prepoznavanja dejavnikov tveganja za zgodnje pojavne bolezni, kot je avtizem. Metoda Wittkowskega ne gleda samo na posamezne SNP-je, temveč pri kombinacijah več SNP-jev, kar ustreza pogledu celotnih besed in ne samo posameznih črk, ki jih tvorijo.

Wittkowski je uporabil ta "multivariatni" pristop k podatkom iz študij avtizma, pa tudi študije epilepsije odsotnosti otrok, pogoj, ki se izkaže za podoben genetski profil.

Prvič, v študiji 185 primerov otroške epilepsije je ekipa Wittkowskega ugotovila, da so mutacije v genih, ki nadzorujejo aksonalno vodenje in kalcijsko signalizacijo, ki sta oba zgodnja v možganih v razvoju, ko nevroni tvorijo ustrezne povezave, pripeljali do večje možnosti za nastanek motnje. To je spodbudilo raziskovalce, da si podrobneje ogledajo podatke iz ene od največjih študij avtizma v državi, ki vsebujejo zaporedje genomov približno 2700 posameznikov. Z uporabo njihovega močnejšega statističnega pristopa so raziskovalci ugotovili, da so grozdi mehanistično povezanih genov, kjer so prejšnje študije le predlagale nekaj izoliranih SNP-jev. Njihovo delo je vključevalo razpad Ras - kalcijsko odvisno signalizacijsko omrežje, ki spodbuja nevronsko rast - saj ima ključno vlogo pri avtizmu.

Če jih potrdimo s kliničnimi raziskavami, podatki kažejo na možnost, da bi lahko zgodnje farmacevtsko posredovanje bistveno vplivalo na razvoj bolezni. "Naši rezultati kažejo, da zdravila, ki se trenutno uporabljajo za zdravljenje epilepsije v otroštvu - modulatorji ionskih kanalov, koristen učinek na posameznike z avtizmom, če jih dobimo ob pravem času med 9 in 24 meseci starosti ", pravi Wittkowski.

"Posledice papirja niso omejene na avtizem, " pravi Wittkowski. "Naš pristop bo verjetno" oživel "študije združevanja v genomu kot strategijo za določanje genetskih dejavnikov tveganja in razvijanje novih možnosti zdravljenja za številne bolezni, tako kot so ljudje upali, ko je bil genetski kodek dešifriran pred desetletjem . "

oglas



Story Source:

Materiali, ki jih ponuja Univerza Rockefeller . Opomba: Vsebino lahko uredite za slog in dolžino.


Referenčni opis revije :

  1. KM Wittkowski, V Sonakya, B Bigio, MK Tonn, F Shic, M Ascano, C Nasca, G Gold-Von Simson. Nov računalniški pristop biostatistike pomeni poslabšanje deposforilacije receptorjev rastnega faktorja, povezanih s težo avtizma . Translacijska psihiatrija, 2014; 4 (1): e354 DOI: 10.1038 / tp.2013.124