Priljubljene Objave

Izbira Urednika - 2019

Novi model populacijske genetike bi lahko pojasnil Finn, evropske genetske razlike

Anonim

Nov model populacijske genetike, ki so ga razvili raziskovalci na Univerzi v Teksasu na zdravstvenem področju na Houstonovi (UTHealth) šoli za javno zdravje, bi lahko pojasnila, zakaj je genetska sestava finskega ljudstva tako različna od drugih evropskih populacij. Rezultati študije so bili objavljeni v izdaji Nature Genetics v tem mesecu.

oglas


UTHealth raziskovalci odkrili prej neznano ozko grlo, ki se je verjetno zgodilo med 10.000 do 20.000 leti v finskem prebivalstvu, ki se ni pojavil v drugih evropskih populacijah. Ozka grla je čas, ko se velikost populacije znatno zmanjša in nato opomore. Ozka grla je mogoče razložiti z velikimi dogodki, kot so migracija, okoljski dogodki, bolezen ali vojna. Ker je po ozkih grlih manj ljudi, imajo potomci prebivalstva manj genetskih razlik, kot je na primer na Finskem.

"Ugotovitev človeške zgodovine od velikosti prebivalstva je pomembno vprašanje populacijske genetike. Obstajajo nekatere metode, da bi določili velikost populacije, vendar lahko ta novi model zagotovi podrobnejšo sliko", je dejala Xiaoming Liu, doktorat, vodilni avtor in docent na oddelku za epidemiologijo, humano genetiko in okoljske vede na UTHealth School of Public Health.

V preteklosti bi lahko raziskovalci bodisi vnaprej določili demografski model bodisi poskušali biti fleksibilni pri proučevanju populacijske genetike. Drugi model je primernejši za raziskovalno analizo.

Nova metoda je oblika prilagodljivega modela. Imenovana je ploskev stopnic, modelira frekvenco enojnih nukleotidnih polimorfizmov (SNP) v celokupnih zaporedjih genoma na stotine posameznikov. SNP-ji so najpogostejša in obilna sprememba sekvence DNA v genomih. Raziskovalci so ta model uporabili za vzorec tisočih genomov, zbranih v okviru projekta 1000 Genoma.

Projekt 1000 Genomes, ustanovljen leta 2008, je mednarodno raziskovalno delo za določitev najbolj podrobnega kataloga genetske variacije človeka. Projekt vključuje genske vzorce iz inštitutov po vsem svetu.

Liu in soavtor Yun-Xin Fu, doktorat, Betty Wheless Trotter profesor na Oddelku za biostatistiko na UTHealth School of Public Health, preučil genomov iz devetih populacij, vključno z evropskimi, afriškimi in azijskimi predniki.

Raziskovalci so tudi potrdili že ugotovljeno ozko grlo v afriškem prebivalstvu med 100.000 do 200.000 leti. Po mnenju Liu in drugih genetskih raziskovalcev je to ozko grlo mogoče povezati s poreklom sodobnega človeka. Strokovnjaki še vedno špekulirajo o vzroku finskega ozkega grla.

oglas



Story Source:

Materiali, ki jih je zagotovil University of Texas Health Sciences Center v Houstonu . Opomba: Vsebino lahko uredite za slog in dolžino.


Referenčni opis revije :

  1. Xiaoming Liu, Yun-Xin Fu. Raziskovanje sprememb velikosti populacije s frekvenčnimi spektri SNP . Naravna genetika, 2015; 47 (5): 555 DOI: 10.1038 / ng.3254